Le centre de Tokyo est hébergé au Toyo Bunko, une des plus importantes bibliothèques orientalistes du monde.
Les bâtiments du Toyo Bunko se composent d’un musée — qui présente, à partir des ouvrages conservés dans ses fonds, trois expositions par an —, d’une salle de lecture et de reproduction des documents, de réserves et de salles de séminaire. La bibliothèque comporte plus d’un million d’ouvrages et accueille depuis 2020 le fonds du sinologue Henri Cordier (1849-1925).